Skip to end of metadata
Go to start of metadata

You are viewing an old version of this page. View the current version.

Compare with Current View Page History

« Previous Version 7 Next »

Example without risk factors

##CanRisk 2.0
##FamID Name Target IndivID FathID MothID Sex MZtwin Dead Age Yob BC1 BC2 OC PRO PAN Ashkn BRCA1 BRCA2 PALB2 ATM CHEK2 BARD1 RAD51D RAD51C BRIP1 ER:PR:HER2:CK14:CK56
XX1 104 0 MGO 0 0 F 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX1 103 0 MGA 0 0 M 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX1 102 0 PGO 0 0 F 0 1 40 1915 40 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX1 101 0 PGA 0 0 M 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX1 201 0 PF PGA PGO M 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX1 202 0 PM MGA MGO F 0 1 61 1940 55 0 44 0 0 0 S:P 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 S:P 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX1 301 1 PB PF PM F 0 0 56 1967 0 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0

Example with risk factors and multiple pedigrees

Below is an example with twofamilies: XX0 and XXX1. For each family, the Header containing the target's risk factors precedes the Pedigree Data section. In the case of families XX0 and XX1, risk factors have been specified for the target. 

##CanRisk 2.0
##menarche=14
##parity=1
##first_live_birth=32
##oc_use=N
##mht_use=N
##BMI=24.28
##alcohol=15.4
##menopause=52
##height=171
##FamID Name Target IndivID FathID MothID Sex MZtwin Dead Age Yob BC1 BC2 OC PRO PAN Ashkn BRCA1 BRCA2 PALB2 ATM CHEK2 BARD1 RAD51D RAD51C BRIP1 ER:PR:HER2:CK14:CK56
XX0 104 0 MGO 0 0 F 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX0 103 0 MGA 0 0 M 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX0 102 0 PGO 0 0 F 0 1 40 1915 40 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX0 101 0 PGA 0 0 M 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX0 201 0 PF PGA PGO M 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX0 NA 0 KGbN 0 0 M 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX0 202 0 PM MGA MGO F 0 1 61 1940 55 0 44 0 0 0 S:P 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 S:P 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX0 301 1 PB PF PM F 0 0 56 1967 0 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX0 NA 0 JksL KGbN PB F 0 0 24 1999 0 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0
##Menarche=12
##BMI=23.1
##height=162
XX1 104 0 MGO 0 0 F 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX1 103 0 MGA 0 0 M 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX1 102 0 PGO 0 0 F 0 1 80 1919 70 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX1 101 0 PGA 0 0 M 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX1 201 0 PF PGA PGO M 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0
XX1 202 0 PM MGA MGO F 0 1 68 1940 57 0 44 0 0 0 S:P S:N S:N S:N S:N S:N S:N S:N S:N 0:0:0:0:0
XX1 301 1 TG PF PM F 0 0 43 1979 0 0 0 0 0 0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0 0:0:0:0:0



  • No labels